CancerCell发现新的卵巢癌ln
近日，美国宾夕法尼亚大学研究者在CancerCell上发布了其关于卵巢癌发生相关lncRNA的最新研究成果。
癌细胞基因组非常混乱，且常常出现拷贝数变异(somaticcopy-numberalterations，SCNAs)。虽然大多数拷贝数变异都是基因组不稳定造成的，但有一少部分SCNAs会致癌。使用大规模基因组图谱和全基因功能筛选已经可以发现致癌的蛋白编码SCNAs。但是，人体内蛋白编码序列很少，癌细胞中许多SCNA都在非编码区域。
本项研究中，研究者将目光集中于lncRNA拷贝数变异同癌症发生的关系上，他们分析了不同数据库中癌症样本的SNP检测结果，从GENCODE中检索了个lncRNA的遗传位置，并计算了每个lncRNA的SCNA频率，筛选出个出现SCNA的lncRNA，其中56个为获得性拷贝数变异(copy-numbergain)，个为缺失性拷贝数变异(copy-numberloss)。使用shRNA在数个癌细胞系中沉默这些lncRNA，发现在沉默FAL1基因(focallyamplifiedlncRNAonchromosome1)时在体内和体外都会显著减少癌细胞数目，将此lncRNA的cDNA导入卵巢表皮细胞，也会诱导细胞增殖，且在对个卵巢癌晚期病人癌细胞进行检测后，发现FAL1的获得性SCNA与病人存活率降低有关。
为了探明FAL1获得性SCNA的致癌机制，研究者首先检测了更多癌细胞中FAL1RNA转录情况，结果发现，FAL1RNA转录同获得性SCNA为正向相关。使用RNApulldown、WesternBloting及RIPqPCR确认FAL1RNA的结合蛋白为BMI1。如果用shRNA沉默FAL1，会明显减少BMI1蛋白表达量，但其mRNA却不受影响。使用放线菌酮处理细胞，也会下调FAL1，BMI1蛋白半衰期会降低，这些结果表明FAL1RNA可能起到未定BMI1蛋白的作用。由于BMI1又是PRC1(poly 最后，研究者还使用卵巢癌小鼠模型，针对FAL1这个lncRNA验证了siRNA的治疗潜力。结果发现，在使用siRNA后，小鼠肿瘤出现了明显的减小，也证明针对FAL1的siRNA治疗具有明显效果，表明FAL1在未来或许可以成为一个卵巢癌治疗靶点。
本研究从海量的非编码区域中发现了一个致癌lncRNA—FAL1，使用不同实验技术，从细胞及动物水平证明了FAL1的致癌效果及其机制。
锐博生物在近期推出了人基因组重测序联合转录组测序方案，通过结合两者的测序优势，通过联合分析，可以为研究者从全基因组范围内筛选与癌症发生相关的lncRNA。同时，锐博生物也利用核心专利技术独立研发出用于细胞水平及动物水平的siRNA，利用全球最先进的高通量筛选及小动物活体成像平台，为研究者打造最全面、最有深度的研究策略，是您最佳合作伙伴!
原文题目
AFunctionalGenomicApproachIdentifiesFAL1asanOncogenicLongNoncodingRNAthatAssociateswithBMI1andRepressesp21ExpressioninCancer
赞赏
长按
